Eestis oli hävituspataljonide põhiülesanne võitlus metsavendadega, samuti põletatud maa taktika elluviimine. Sellega kaasnes jõhker terror tsiviilelanikkonna suhtes, õõvastavad sõjakuriteod, mille järgi teatakse ja mäletatakse hävituspataljone tänaseni.